More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4523 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 998 aa  2026    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  42.55 
 
 		 977 aa  732    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  37.01 
 
 		 986 aa  627  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  36.5 
 
 		 1016 aa  611  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1040 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1120 aa  327  6e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1177 aa  326  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1043 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1023 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1161 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 1029 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 1014 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1008 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1071 aa  313  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1038 aa  313  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1046 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  27.38 
 
 		 1019 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1006 aa  306  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1076 aa  303  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 999 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 986 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1027 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 982 aa  297  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1010 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 1037 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1128 aa  293  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1114 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1124 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1132 aa  289  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1066 aa  287  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1028 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 1050 aa  284  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1079 aa  283  9e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1051 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1088 aa  281  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 1038 aa  280  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1039 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 1078 aa  277  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1103 aa  277  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1181 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 1028 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 1050 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1129 aa  273  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1155 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.31 
 
 		 1041 aa  271  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1176 aa  271  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  25.35 
 
 		 1024 aa  270  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 1039 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1102 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1155 aa  268  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 1034 aa  267  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1047 aa  266  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 1000 aa  265  4.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1102 aa  264  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1198 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1116 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1066 aa  261  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 996 aa  261  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1011 aa  260  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 1144 aa  260  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1173 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 994 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  24.95 
 
 		 989 aa  259  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 1041 aa  258  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 1071 aa  258  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 1026 aa  257  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1023 aa  257  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 1019 aa  257  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 997 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1006 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 1020 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 1152 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1079 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1122 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1129 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 986 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 1094 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1177 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 1051 aa  252  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1059 aa  250  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1027 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1023 aa  249  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 1044 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1082 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 1014 aa  246  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1075 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 1140 aa  241  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1113 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 984 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1148 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 		 1059 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 1119 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  24.71 
 
 		 1063 aa  237  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1017 aa  237  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1013 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1115 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 1004 aa  235  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1043 aa  235  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1084 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 1081 aa  235  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>