More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2729 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  50.76 
 
 		 1024 aa  997    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  47.14 
 
 		 1019 aa  899    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  38.9 
 
 		 1161 aa  638    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  51.07 
 
 		 1028 aa  963    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  54.29 
 
 		 1014 aa  1099    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  47.77 
 
 		 1120 aa  935    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  57.74 
 
 		 1043 aa  1196    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 999 aa  2030    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  38.58 
 
 		 1010 aa  629  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  37.87 
 
 		 989 aa  621  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  36.43 
 
 		 1027 aa  599  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 982 aa  602  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  36.58 
 
 		 1023 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 		 1037 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 986 aa  586  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1071 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 1038 aa  545  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 		 1140 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  34.7 
 
 		 1051 aa  536  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 1177 aa  536  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.55 
 
 		 1066 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 1132 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1155 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 1008 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 1029 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 1071 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 1019 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1114 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1012 aa  508  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1173 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1181 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.9 
 
 		 1041 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1039 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 1050 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1028 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1006 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 997 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 		 1129 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  34.03 
 
 		 925 aa  488  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 		 1026 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1155 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1079 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1154 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  33.92 
 
 		 1124 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1154 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 1128 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1163 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1081 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1152 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1096 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1051 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.67 
 
 		 1023 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1039 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1066 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 994 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1097 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1122 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 1116 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 996 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1117 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 1038 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1076 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1021 aa  458  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 1025 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1006 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1164 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  31.68 
 
 		 1018 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1076 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  30.83 
 
 		 1035 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1076 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1154 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 1033 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 1060 aa  446  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1064 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 1034 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1052 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 1080 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 1000 aa  439  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 1020 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1059 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1023 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1006 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1023 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1103 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1062 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1023 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1020 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1014 aa  436  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1075 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1082 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1147 aa  436  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1017 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1070 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 992 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1053 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1139 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1150 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1127 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.48 
 
 		 1063 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1148 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>