More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2600 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  49.67 
 
 		 1152 aa  1013    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  58.94 
 
 		 1028 aa  1202    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  53 
 
 		 1132 aa  1082    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  47.96 
 
 		 1096 aa  940    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  50.63 
 
 		 1150 aa  1003    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  39.89 
 
 		 1161 aa  686    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  49.58 
 
 		 1059 aa  1005    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  38.26 
 
 		 1080 aa  655    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  39.33 
 
 		 1053 aa  666    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1051 aa  2120    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 		 1037 aa  649    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  39.13 
 
 		 1040 aa  666    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  37.26 
 
 		 1038 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  54.05 
 
 		 1163 aa  1060    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  46.81 
 
 		 1154 aa  902    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  38.45 
 
 		 1049 aa  628  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  37 
 
 		 1029 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1155 aa  622  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  36.72 
 
 		 1177 aa  611  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  37.01 
 
 		 1041 aa  608  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1066 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  36.29 
 
 		 1181 aa  601  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  37.24 
 
 		 1114 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1071 aa  592  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  35.67 
 
 		 1006 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  35.32 
 
 		 1080 aa  580  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  37.55 
 
 		 989 aa  580  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  36.86 
 
 		 1019 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  36.96 
 
 		 1010 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 		 1039 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  35.57 
 
 		 1079 aa  569  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  36.06 
 
 		 1173 aa  562  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  36.29 
 
 		 1148 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 1116 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  36.79 
 
 		 1012 aa  559  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 1117 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 1063 aa  554  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  36.03 
 
 		 1124 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  34.54 
 
 		 1071 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 1000 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.92 
 
 		 1122 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 1008 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 		 999 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  36.35 
 
 		 1097 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 1051 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  34.54 
 
 		 1025 aa  532  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 982 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  34.82 
 
 		 1023 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 1050 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1164 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 994 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1023 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 996 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1066 aa  519  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1076 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1155 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 1026 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 1014 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1129 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 986 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 1038 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1076 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 1043 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 1060 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1081 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1039 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1027 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1128 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 979 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1006 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1096 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1023 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1023 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1021 aa  491  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1103 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1042 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1075 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1036 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1017 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1071 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1014 aa  480  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1076 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 1034 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 1102 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1119 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1052 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1065 aa  476  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1154 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 1041 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1106 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1034 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1147 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1013 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 996 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1082 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1137 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 1144 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1172 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1010 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 1140 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>