More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4717 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  36.96 
 
 		 1113 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  54.24 
 
 		 1051 aa  1094    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1155 aa  2356    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  52.63 
 
 		 1076 aa  1053    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  38.33 
 
 		 1037 aa  661    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  39.22 
 
 		 1161 aa  765    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  53.58 
 
 		 1076 aa  1055    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  51.19 
 
 		 1076 aa  1014    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  45.25 
 
 		 1038 aa  877    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  36.07 
 
 		 1177 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 1114 aa  623  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  35.21 
 
 		 1181 aa  619  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  36.96 
 
 		 1038 aa  608  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 1029 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 		 1117 aa  596  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 		 1155 aa  589  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1128 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1124 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1097 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 1019 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1116 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  37.25 
 
 		 1026 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1028 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  35.88 
 
 		 1039 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 1000 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1132 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 1066 aa  546  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 1008 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 1050 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1039 aa  542  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.08 
 
 		 1041 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 		 1027 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1053 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1164 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1071 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  36.2 
 
 		 1096 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 1071 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  33.19 
 
 		 1102 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1023 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.81 
 
 		 1122 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1148 aa  523  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  35.7 
 
 		 1013 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1147 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1163 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1096 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 		 1140 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 982 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1103 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1023 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1051 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1006 aa  512  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 986 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 994 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 		 996 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  34.49 
 
 		 1025 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1077 aa  503  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1079 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1049 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 1012 aa  494  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1129 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1105 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 1043 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1021 aa  490  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1150 aa  489  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 1144 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1075 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 999 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 1014 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1017 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 989 aa  486  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1042 aa  483  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1064 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  33.61 
 
 		 1063 aa  482  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 1175 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1023 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1152 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  33.23 
 
 		 1006 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1040 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1010 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1041 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1154 aa  476  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1137 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 1080 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1168 aa  473  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1034 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 1173 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1081 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1192 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1120 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1010 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 1154 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 1034 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1125 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 1033 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 1041 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  34.22 
 
 		 1179 aa  466  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1079 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1060 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1060 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.44 
 
 		 1023 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>