More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1473 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1021 aa  2099    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 1037 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1161 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1059 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1096 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 1050 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1040 aa  524  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1038 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 		 1079 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1152 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1028 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1132 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1150 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 1008 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1053 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.99 
 
 		 1051 aa  496  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 982 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1051 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1155 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1181 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1177 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1124 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1027 aa  486  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1049 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1163 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1173 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1128 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 986 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1114 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 1029 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1155 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 989 aa  478  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1012 aa  476  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1006 aa  476  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1066 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 1043 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1071 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 1063 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1066 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1154 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.19 
 
 		 1063 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1023 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.97 
 
 		 1023 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1039 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1039 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 1025 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 999 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 1014 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1023 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.4 
 
 		 1041 aa  456  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1116 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 1019 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 1198 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 994 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1122 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1071 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 1000 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 996 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1076 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1117 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1014 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1023 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1148 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1076 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 1140 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 979 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1147 aa  439  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 1008 aa  435  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1080 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1096 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1103 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1079 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1023 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1081 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1077 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1013 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1076 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  31.69 
 
 		 1024 aa  428  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1010 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 1038 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  31.4 
 
 		 1019 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 1034 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1060 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  30.62 
 
 		 1002 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  30.77 
 
 		 1047 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1075 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1064 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1097 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 1011 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  30.19 
 
 		 1018 aa  417  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 1041 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1129 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 1065 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1172 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 999 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1106 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1164 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 1028 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1043 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1020 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>