More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0106 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  40.89 
 
 		 996 aa  643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  41.68 
 
 		 1026 aa  718    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  42.24 
 
 		 1039 aa  756    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  40.96 
 
 		 1117 aa  786    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  37.32 
 
 		 1152 aa  648    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  45.28 
 
 		 1029 aa  814    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  39.08 
 
 		 986 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  38.35 
 
 		 989 aa  644    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  40.76 
 
 		 982 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  41.87 
 
 		 1155 aa  717    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  38.42 
 
 		 1027 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  40.51 
 
 		 1000 aa  686    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  39.83 
 
 		 1163 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  39.35 
 
 		 1023 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  42.05 
 
 		 1041 aa  762    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  37.3 
 
 		 1164 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  40.23 
 
 		 1006 aa  697    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1148 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  41.71 
 
 		 1124 aa  756    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  38.51 
 
 		 1181 aa  775    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  39.43 
 
 		 1071 aa  655    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  39.89 
 
 		 1051 aa  684    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  38.9 
 
 		 999 aa  638    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  40.13 
 
 		 1132 aa  709    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  40.55 
 
 		 1076 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  41.51 
 
 		 1066 aa  735    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  38.3 
 
 		 1079 aa  669    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  42.78 
 
 		 1177 aa  789    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  39.33 
 
 		 1025 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  37.19 
 
 		 1071 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  45.48 
 
 		 1038 aa  854    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 		 1116 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  39.68 
 
 		 1051 aa  670    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  38.31 
 
 		 1010 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  39.38 
 
 		 1114 aa  796    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  39.08 
 
 		 1050 aa  692    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  47.92 
 
 		 1037 aa  926    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  40.84 
 
 		 1012 aa  649    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  40.34 
 
 		 1173 aa  674    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  43.56 
 
 		 1019 aa  777    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  40.47 
 
 		 1008 aa  697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  40.89 
 
 		 1128 aa  705    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  40.61 
 
 		 1028 aa  696    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1161 aa  2331    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  39.38 
 
 		 1076 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  38.98 
 
 		 1038 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  42.81 
 
 		 1097 aa  771    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  39.22 
 
 		 1155 aa  765    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  39.32 
 
 		 1076 aa  667    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  37.98 
 
 		 1023 aa  629  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  39.4 
 
 		 1034 aa  627  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  37.67 
 
 		 1059 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  39.15 
 
 		 994 aa  622  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  38.03 
 
 		 1060 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  37.52 
 
 		 1150 aa  619  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  37.39 
 
 		 1154 aa  616  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  37.45 
 
 		 1063 aa  613  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  37.25 
 
 		 1081 aa  613  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  37.79 
 
 		 1039 aa  612  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 1023 aa  613  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  38.22 
 
 		 1014 aa  609  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  37.54 
 
 		 1071 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  37.26 
 
 		 1053 aa  609  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1122 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  37.23 
 
 		 1103 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  37.31 
 
 		 1043 aa  598  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  37.12 
 
 		 1049 aa  597  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  36.98 
 
 		 1075 aa  598  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  36.82 
 
 		 1096 aa  593  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 1168 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  37.11 
 
 		 1064 aa  595  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  38.6 
 
 		 1013 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1106 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  36.95 
 
 		 996 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 1147 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  36.64 
 
 		 1096 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 1177 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  36.6 
 
 		 1079 aa  578  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  37.05 
 
 		 1023 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1137 aa  571  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 1017 aa  568  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  37.09 
 
 		 1082 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 1041 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1119 aa  566  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  35.13 
 
 		 1006 aa  562  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  35.86 
 
 		 1034 aa  562  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1021 aa  560  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 		 1062 aa  562  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  35.91 
 
 		 1154 aa  558  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  36.22 
 
 		 1192 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1120 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  36.41 
 
 		 1129 aa  558  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  36.56 
 
 		 1028 aa  555  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 1020 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  36.09 
 
 		 1010 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  35.67 
 
 		 1060 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  36.95 
 
 		 1019 aa  552  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 1065 aa  552  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  35.57 
 
 		 1137 aa  552  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  35.31 
 
 		 1040 aa  552  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>