More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3704 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  36.65 
 
 		 1117 aa  673    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  38.74 
 
 		 1161 aa  708    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  36.41 
 
 		 1124 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  41.59 
 
 		 1029 aa  706    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  39.96 
 
 		 1038 aa  696    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  37.42 
 
 		 1177 aa  681    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  37.57 
 
 		 1116 aa  668    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  36.82 
 
 		 1114 aa  715    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  40.4 
 
 		 1037 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 		 1155 aa  639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1128 aa  2294    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  37.12 
 
 		 1097 aa  697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  34.22 
 
 		 1122 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  38.18 
 
 		 1008 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1173 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  36.5 
 
 		 1039 aa  608  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1181 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.41 
 
 		 1066 aa  592  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  36.88 
 
 		 1006 aa  586  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1155 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  36.91 
 
 		 1000 aa  582  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  36.39 
 
 		 1019 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.05 
 
 		 1071 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  37.62 
 
 		 996 aa  566  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1132 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  35.96 
 
 		 1076 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 		 994 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 1050 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  36.69 
 
 		 982 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1148 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 		 1161 aa  552  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33.81 
 
 		 1147 aa  549  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 1071 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.97 
 
 		 1041 aa  549  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  34.32 
 
 		 1017 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1163 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  35.69 
 
 		 986 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1006 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1154 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  36.4 
 
 		 1034 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  35.28 
 
 		 1051 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1102 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1076 aa  543  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 1079 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1058 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  33.39 
 
 		 1144 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.46 
 
 		 1026 aa  539  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  34.15 
 
 		 1063 aa  533  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1119 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  35.91 
 
 		 1023 aa  531  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1096 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 1038 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  35.06 
 
 		 1198 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 989 aa  527  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1152 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 1014 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1064 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1106 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  36.34 
 
 		 1076 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1168 aa  526  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 1128 aa  522  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  34.19 
 
 		 1034 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1164 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1137 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 		 1103 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1082 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.91 
 
 		 1012 aa  518  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  35.97 
 
 		 1013 aa  519  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1079 aa  516  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  33.19 
 
 		 1154 aa  515  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1023 aa  515  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1023 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1103 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  33.36 
 
 		 1094 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1172 aa  512  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1179 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1028 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1023 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 1090 aa  506  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1129 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1137 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  34.85 
 
 		 1060 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 1025 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  33.39 
 
 		 1080 aa  503  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.85 
 
 		 1023 aa  502  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 1189 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1075 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1139 aa  502  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1071 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1036 aa  503  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 1043 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1192 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1051 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1059 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 1011 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  34.96 
 
 		 979 aa  496  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1053 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1081 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1052 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 1177 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>