More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3123 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1139 aa  2330    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 1026 aa  574  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  35.93 
 
 		 1033 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 1128 aa  564  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1164 aa  559  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  35.36 
 
 		 1023 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1155 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 1116 aa  539  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1177 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 1012 aa  526  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1179 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 1020 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 1177 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1192 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1114 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 1037 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 1189 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1202 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1130 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1052 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1128 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 1049 aa  496  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1161 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1124 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1161 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1181 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1127 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 1034 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 1175 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  33.07 
 
 		 1038 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1163 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1132 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1082 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1064 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1036 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1008 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1060 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1164 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  32.28 
 
 		 1002 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 989 aa  460  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1154 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  31.99 
 
 		 1005 aa  456  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 1043 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1148 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1152 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 1029 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 1050 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1075 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  32.42 
 
 		 1043 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1039 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1066 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1129 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1006 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1071 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1154 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1122 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1062 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1003 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  32.66 
 
 		 1035 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 1140 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1006 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1097 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  32.07 
 
 		 1041 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1119 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1085 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1084 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1079 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 1144 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1051 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.22 
 
 		 1063 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1027 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1146 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1117 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1116 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1023 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 999 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1079 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1010 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 982 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 1040 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1006 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1031 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 		 1010 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 1011 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1081 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1102 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1138 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 1047 aa  421  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1053 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 1010 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 1055 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 1025 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1150 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 986 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1039 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1020 aa  419  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 1094 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 1144 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1168 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1059 aa  413  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>