More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5549 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  44 
 
 
1043 aa  865    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  39.3 
 
 
1049 aa  675    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
1036 aa  2124    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  41.07 
 
 
1116 aa  702    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 
1026 aa  592  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  37.78 
 
 
1033 aa  592  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  37.23 
 
 
1012 aa  569  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  35.74 
 
 
1023 aa  571  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.81 
 
 
1037 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 
1020 aa  559  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  36.21 
 
 
1011 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.25 
 
 
1161 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 
1082 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  35.41 
 
 
989 aa  537  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 
1064 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 
1175 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 
1006 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 
1010 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 
1177 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 
1060 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 
1039 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  36 
 
 
1029 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 
986 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 
1066 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 
1034 aa  515  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 
1164 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 
1128 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 
1006 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 
1084 aa  512  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 
982 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 
1038 aa  509  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  35.35 
 
 
1041 aa  507  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  32.97 
 
 
1005 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 
1177 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 
1085 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 
1128 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  34.48 
 
 
1002 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 
1189 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 
1202 aa  492  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 
1083 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 
1004 aa  483  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 
1132 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 
1096 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 
1031 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 
1148 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 
1062 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 
1097 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 
1114 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 
1008 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.93 
 
 
1063 aa  472  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 
1122 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 
1077 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 
1155 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 
1124 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 
1020 aa  468  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 
1139 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 
1130 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 
1027 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 
1028 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 
1192 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 
1052 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 
1150 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 
1119 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 
1026 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 
1071 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 
1075 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 
1137 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 
1116 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 
1003 aa  452  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 
1163 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 
1172 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 
1117 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 
1051 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 
1047 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 
1065 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 
1079 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 
1023 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 
1025 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 
1039 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 
1023 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 
1181 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
1130 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 
1050 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 
1031 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 
1051 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 
1173 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 
1144 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 
994 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 
1081 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 
1060 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 
1161 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 
996 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 
1004 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 
1146 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 
1127 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 
996 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 
1168 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 
1019 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 
1152 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 
1038 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>