More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0932 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  38.78 
 
 		 1034 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  51.28 
 
 		 1023 aa  1028    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1012 aa  2068    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  40.84 
 
 		 1161 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 982 aa  636    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  42.13 
 
 		 1026 aa  706    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 1037 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  38.14 
 
 		 1177 aa  630  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  36.69 
 
 		 1063 aa  626  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  36.91 
 
 		 989 aa  623  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  37.22 
 
 		 986 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  38.7 
 
 		 1124 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  37.29 
 
 		 1041 aa  613  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  36.58 
 
 		 1181 aa  612  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  37.37 
 
 		 1114 aa  607  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 1033 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  35.31 
 
 		 1064 aa  601  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  38.39 
 
 		 1132 aa  601  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  37.58 
 
 		 1071 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  36.51 
 
 		 1122 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  37.83 
 
 		 1164 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 		 1082 aa  595  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  36.71 
 
 		 1038 aa  591  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  38.63 
 
 		 1029 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  37.26 
 
 		 1036 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  37.4 
 
 		 1028 aa  589  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  35.79 
 
 		 1075 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1071 aa  586  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  38.12 
 
 		 1097 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  37.12 
 
 		 1043 aa  585  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  37.68 
 
 		 1000 aa  585  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  37.33 
 
 		 1155 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  36.64 
 
 		 1020 aa  582  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  35.81 
 
 		 1039 aa  581  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  36.76 
 
 		 1023 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1052 aa  571  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  35.66 
 
 		 1020 aa  569  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  36.3 
 
 		 1051 aa  572  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  35.81 
 
 		 1010 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  36.35 
 
 		 1117 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 1006 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  36.99 
 
 		 1002 aa  564  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 1177 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1066 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 1189 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 1008 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 1049 aa  557  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1062 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 1175 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  36.18 
 
 		 1116 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 1051 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  36.08 
 
 		 1041 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 		 1047 aa  546  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  36.87 
 
 		 1163 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  37.08 
 
 		 1019 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  34.39 
 
 		 1085 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 1139 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  36.58 
 
 		 1011 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1060 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 1006 aa  542  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 1129 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 1065 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 1128 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1039 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1103 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1014 aa  538  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 		 1003 aa  534  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 1050 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1010 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 1004 aa  534  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 1025 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1079 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 1140 aa  532  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1060 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 		 1076 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 999 aa  529  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 1059 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 		 1173 aa  525  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 1192 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 		 1147 aa  526  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  34.61 
 
 		 1076 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1023 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 		 1026 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  34.65 
 
 		 1005 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 1096 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1081 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1152 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1202 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  35.05 
 
 		 1053 aa  516  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  35.39 
 
 		 1096 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 		 1006 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1038 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1155 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  34.96 
 
 		 1040 aa  512  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1148 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1084 aa  509  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 1128 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 1130 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  34.99 
 
 		 1127 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1076 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>