More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2292 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  38.54 
 
 		 1181 aa  668    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  41.87 
 
 		 1081 aa  753    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  37.39 
 
 		 1058 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  37.96 
 
 		 1066 aa  680    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  38.52 
 
 		 1177 aa  671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  43.72 
 
 		 1122 aa  854    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  38.2 
 
 		 1079 aa  643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  41.83 
 
 		 1036 aa  761    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  44.36 
 
 		 1060 aa  771    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1023 aa  2077    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  37.3 
 
 		 1066 aa  635  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 1050 aa  631  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  36.92 
 
 		 1079 aa  619  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 1161 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 1037 aa  607  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.88 
 
 		 1155 aa  605  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  35.86 
 
 		 1173 aa  586  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  36.1 
 
 		 1148 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  37.09 
 
 		 1038 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 1071 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.46 
 
 		 1008 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 1029 aa  559  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  35.52 
 
 		 1006 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 1071 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1039 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.73 
 
 		 1114 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  35.59 
 
 		 1117 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  36.71 
 
 		 1012 aa  552  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  36.66 
 
 		 1124 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  36.01 
 
 		 989 aa  546  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 		 1026 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 		 1000 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1155 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  34.7 
 
 		 1023 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1051 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 986 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  35.01 
 
 		 1051 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1119 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1097 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  35.22 
 
 		 1028 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1023 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.23 
 
 		 1041 aa  507  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  33.4 
 
 		 1063 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  34.32 
 
 		 1172 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1128 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 1053 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1137 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1006 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1039 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1059 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1064 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1023 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  35.3 
 
 		 1011 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1164 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1071 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 		 1027 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 1177 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 982 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 1116 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1076 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  32.53 
 
 		 1047 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 1038 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1010 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 1025 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1010 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 1019 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1163 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 1034 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 1033 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  34.86 
 
 		 1154 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1049 aa  476  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1129 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1017 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1062 aa  476  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 1140 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1150 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1132 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  33.11 
 
 		 1043 aa  465  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1076 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 994 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1076 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 1020 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1096 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1021 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1102 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1152 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1042 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1116 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 996 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1075 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1034 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1096 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1020 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1113 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.85 
 
 		 1002 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 1043 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1168 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1006 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1127 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1060 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>