More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5672 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  45.18 
 
 		 1006 aa  859    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  38.93 
 
 		 1168 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1017 aa  2058    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  46.52 
 
 		 996 aa  899    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  38.54 
 
 		 1050 aa  667    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  39.45 
 
 		 1102 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  68.21 
 
 		 1034 aa  1398    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  39.23 
 
 		 1144 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  39.02 
 
 		 1096 aa  670    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  42.19 
 
 		 1042 aa  769    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  38.7 
 
 		 986 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  36.39 
 
 		 1030 aa  633  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  39.55 
 
 		 1013 aa  623  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  36.07 
 
 		 1147 aa  624  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  35.98 
 
 		 1105 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  37.47 
 
 		 979 aa  587  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 993 aa  579  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  35.89 
 
 		 1177 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 1161 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1077 aa  559  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1038 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 1114 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 		 1037 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  34.67 
 
 		 1128 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 1038 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  36.35 
 
 		 1029 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1117 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 1000 aa  533  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1066 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 1087 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  35.64 
 
 		 1006 aa  532  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.16 
 
 		 1155 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1079 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 		 1008 aa  526  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 1148 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 1025 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 		 1106 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1033 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1124 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  33.85 
 
 		 1034 aa  516  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1076 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.61 
 
 		 1050 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1019 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 1071 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1122 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1038 aa  506  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1173 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  34.63 
 
 		 1076 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1006 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 982 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 1027 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 		 1028 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1181 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 996 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  35.51 
 
 		 1076 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1097 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1008 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1082 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1039 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1155 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1064 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1116 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.36 
 
 		 1026 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  34.33 
 
 		 1042 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1023 aa  483  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1051 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 994 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1037 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 1010 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1062 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1081 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1071 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1051 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1023 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1132 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.11 
 
 		 1041 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 1140 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 986 aa  466  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1202 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.5 
 
 		 1012 aa  463  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1129 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1077 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 		 1164 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1071 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.59 
 
 		 1023 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1146 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 1060 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 1083 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1084 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1039 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1031 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 989 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 1058 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1075 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1057 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1085 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1096 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 1043 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1036 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 1014 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>