More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2820 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  41.85 
 
 		 1129 aa  869    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  39.33 
 
 		 1037 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1057 aa  2180    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  44.62 
 
 		 1038 aa  909    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  43.23 
 
 		 1042 aa  849    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1087 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1146 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1017 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 993 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1006 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1106 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 979 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1013 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1102 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1077 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1168 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1076 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 1144 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1096 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1076 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1042 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 996 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1161 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1147 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1076 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  29.9 
 
 		 1034 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1177 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1034 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1039 aa  363  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 1038 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 1071 aa  359  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1051 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 1008 aa  357  8.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1048 aa  357  8.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  27.66 
 
 		 1030 aa  357  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  27.95 
 
 		 1041 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1132 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1155 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1181 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 986 aa  347  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1038 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 1050 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1105 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1006 aa  339  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1155 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 1037 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 1029 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1075 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1152 aa  335  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1071 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1010 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1066 aa  332  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1028 aa  332  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1114 aa  330  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1066 aa  330  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1050 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1128 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1008 aa  327  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1023 aa  327  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1117 aa  327  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 1019 aa  327  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1012 aa  325  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1014 aa  322  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1041 aa  320  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1079 aa  319  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 996 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1154 aa  318  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1033 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1163 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1106 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 982 aa  311  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1021 aa  310  9e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 994 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1124 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1027 aa  308  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 1103 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1150 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 999 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 989 aa  302  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1116 aa  303  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1052 aa  303  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1173 aa  302  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1119 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1043 aa  300  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1113 aa  299  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  27.93 
 
 		 1024 aa  299  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 1011 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1023 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1020 aa  298  5e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1006 aa  297  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1172 aa  297  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1079 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1081 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1154 aa  296  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  25.86 
 
 		 1023 aa  295  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 1034 aa  295  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1053 aa  294  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  25.89 
 
 		 1063 aa  294  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 1026 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1060 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>