More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4491 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1129 aa  2320    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  42.15 
 
 		 1057 aa  881    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  39.85 
 
 		 1038 aa  789    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  38.76 
 
 		 1042 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  35.87 
 
 		 1037 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1087 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1146 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 993 aa  406  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 1008 aa  396  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1013 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1017 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 979 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1132 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1102 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1077 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1042 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1034 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 986 aa  357  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1144 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1106 aa  352  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1168 aa  351  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  28.95 
 
 		 1034 aa  349  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 1038 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 1152 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1076 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1076 aa  339  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 1181 aa  337  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 996 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 1050 aa  336  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1105 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1155 aa  330  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1012 aa  329  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.99 
 
 		 1063 aa  323  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1051 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  27.5 
 
 		 1023 aa  320  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1027 aa  316  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1177 aa  314  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1103 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 		 1047 aa  312  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1051 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 1071 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.86 
 
 		 1041 aa  308  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1033 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1019 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1076 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1096 aa  302  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1124 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1154 aa  300  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1006 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1023 aa  298  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1028 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 1140 aa  295  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1023 aa  292  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1127 aa  290  9e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1066 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  27.02 
 
 		 1080 aa  288  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1154 aa  288  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1039 aa  288  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1041 aa  288  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 1029 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 1043 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1031 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1117 aa  283  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1119 aa  280  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1058 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1006 aa  278  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1052 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1062 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1023 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1038 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 999 aa  275  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1129 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 1059 aa  273  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1106 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1085 aa  269  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1065 aa  267  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1006 aa  267  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1024 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  27.09 
 
 		 1111 aa  266  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1060 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 1172 aa  262  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 1013 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1053 aa  260  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 1077 aa  260  9e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  25.62 
 
 		 1024 aa  260  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 1011 aa  259  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 1014 aa  259  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1082 aa  259  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1164 aa  258  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 1063 aa  257  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1143 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1131 aa  256  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 1010 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1064 aa  255  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1045 aa  251  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 1119 aa  251  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1103 aa  250  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1096 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1161 aa  249  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1150 aa  249  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>