More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6053 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
1006 aa  2029    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  44.13 
 
 
1031 aa  751    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  42.04 
 
 
1010 aa  742    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3525  TonB-dependent receptor, plug  39.5 
 
 
1000 aa  616  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 
1038 aa  558  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  35.06 
 
 
1003 aa  557  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 
1026 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  36.1 
 
 
1010 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 
1037 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.52 
 
 
1161 aa  545  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 
1066 aa  539  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 
1064 aa  542  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.68 
 
 
986 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.89 
 
 
1060 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 
1036 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 
1164 aa  532  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  33.36 
 
 
1175 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 
1155 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 
1062 aa  529  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  35.11 
 
 
1005 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 
982 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  36.13 
 
 
1008 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  34.85 
 
 
1148 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 
1181 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 
1012 aa  517  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 
1177 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  35.19 
 
 
1041 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 
1202 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  34.13 
 
 
1043 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 
1084 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  35.49 
 
 
1033 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 
1052 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.22 
 
 
1114 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 
1017 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 
1051 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 
1189 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 
1038 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 
1177 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  34.85 
 
 
1034 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  32.92 
 
 
1002 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 
1029 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  34.39 
 
 
1031 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 
1023 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 
1147 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 
1096 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 
996 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 
1124 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 
1071 aa  493  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 
1034 aa  486  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 
1000 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 
1082 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 
1083 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 
1130 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 
1076 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 
1079 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 
1076 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.78 
 
 
1023 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.03 
 
 
1063 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 
1006 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 
1085 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 
1117 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 
1047 aa  475  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  35.58 
 
 
1150 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 
1128 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 
1077 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 
1027 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 
1020 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 
1039 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 
1076 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 
989 aa  467  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 
1081 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 
1127 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 
1128 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 
1172 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  34.68 
 
 
1102 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 
1050 aa  466  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  33.92 
 
 
1168 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 
1071 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 
1019 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 
1075 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 
1129 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 
1071 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 
1026 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 
1103 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 
976 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 
1047 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 
1144 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 
1004 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 
1155 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 
1049 aa  452  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 
1132 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  35 
 
 
994 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 
1192 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 
1116 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 
1023 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 
1020 aa  449  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 
1055 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 
1139 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 
1006 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 
1039 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>