More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5396 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1023 aa  2078    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 1037 aa  595  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  37.05 
 
 		 1161 aa  585  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.42 
 
 		 1029 aa  578  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  36.15 
 
 		 1116 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 1114 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1008 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1006 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1117 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1124 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1097 aa  542  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 1000 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.47 
 
 		 1038 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1155 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1128 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 1012 aa  519  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 1177 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1059 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1132 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1023 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1066 aa  506  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 1038 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  34.28 
 
 		 1076 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1051 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.47 
 
 		 1023 aa  496  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1051 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  35.44 
 
 		 1102 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1076 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1155 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1071 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1028 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1006 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1019 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1163 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.81 
 
 		 1041 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 1144 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1039 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1075 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1077 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1181 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1122 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 979 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 1050 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1036 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1076 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 986 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 986 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 989 aa  452  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1082 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 1071 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 999 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1021 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1023 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 996 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1137 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1010 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 1175 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1039 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1027 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1064 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1079 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1129 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 1034 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1154 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 982 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1060 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1006 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1081 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1096 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1010 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 1008 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1058 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1152 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1154 aa  435  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1119 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 1025 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 1026 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  31.96 
 
 		 1043 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.89 
 
 		 1063 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1148 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 996 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 988 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 994 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1096 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1040 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1172 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 1140 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1173 aa  426  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1052 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1127 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 1014 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1017 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1026 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1150 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1094 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1164 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 1090 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 999 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 1106 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1084 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>