More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4106 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1048 aa  2116    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  37.12 
 
 		 1146 aa  622  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1087 aa  566  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1106 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 1013 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 979 aa  509  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 993 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 1096 aa  473  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 996 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1161 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1102 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1037 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 1037 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1077 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1038 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 1144 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1006 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1079 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1147 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1051 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1177 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1042 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1038 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1155 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 986 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1034 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 986 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1012 aa  415  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1148 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 1050 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 982 aa  410  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1181 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1163 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1059 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1017 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1129 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 1008 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.44 
 
 		 1023 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1168 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.62 
 
 		 1041 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1041 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1116 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1042 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1132 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1028 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1150 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 1038 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 1000 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1006 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1050 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1152 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1071 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 1025 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1164 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1060 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1105 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1039 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1114 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 989 aa  383  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  28.98 
 
 		 1018 aa  382  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1082 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1124 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1173 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  30.27 
 
 		 1030 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  30.22 
 
 		 1034 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  29.47 
 
 		 1063 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1021 aa  372  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1023 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1076 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1154 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1023 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1066 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 1019 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1029 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1006 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1008 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1066 aa  366  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1192 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1168 aa  365  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1039 aa  363  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1122 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1127 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 1014 aa  362  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 1026 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1010 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1064 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1010 aa  358  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 1033 aa  357  8.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1057 aa  357  8.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 1043 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1076 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1051 aa  354  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1096 aa  354  5e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1049 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1081 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1154 aa  350  7e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 999 aa  350  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  29.44 
 
 		 1024 aa  349  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 994 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1031 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>