More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1657 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  38.45 
 
 		 1066 aa  718    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  46.43 
 
 		 1060 aa  870    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  36.85 
 
 		 1148 aa  685    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  37.23 
 
 		 1181 aa  714    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  44.73 
 
 		 1081 aa  864    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  37.42 
 
 		 1058 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  38.53 
 
 		 1066 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  39.16 
 
 		 1177 aa  783    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  41 
 
 		 1036 aa  746    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1122 aa  2291    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  37.95 
 
 		 1079 aa  653    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  37.64 
 
 		 1071 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  35.22 
 
 		 1114 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  37.25 
 
 		 1050 aa  653    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  43.72 
 
 		 1023 aa  854    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  36.2 
 
 		 1155 aa  724    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  37.37 
 
 		 1079 aa  656    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  35.95 
 
 		 1173 aa  629  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  35.88 
 
 		 1097 aa  631  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  35.61 
 
 		 1117 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1128 aa  610  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1161 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1038 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1124 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 1026 aa  585  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  36.51 
 
 		 1012 aa  581  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 		 1037 aa  582  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 		 1071 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1096 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 1008 aa  569  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.13 
 
 		 1132 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 1029 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  35.46 
 
 		 1027 aa  552  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  35.6 
 
 		 1039 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 1144 aa  549  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 982 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 		 1071 aa  549  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1006 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.92 
 
 		 1051 aa  542  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 1038 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.27 
 
 		 1023 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1116 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1177 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 996 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 994 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  33.45 
 
 		 1119 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1161 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1163 aa  529  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.81 
 
 		 1155 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1164 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1154 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1028 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 1189 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1106 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 1010 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1023 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1172 aa  515  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.24 
 
 		 1041 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1152 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1102 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 1140 aa  513  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1017 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 1043 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1137 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 1000 aa  506  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 1033 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1129 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 986 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1006 aa  499  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1076 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1075 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 1014 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1120 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1103 aa  496  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  32.23 
 
 		 1047 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1154 aa  493  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 989 aa  492  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1076 aa  493  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1034 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 1034 aa  489  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1039 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1127 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  33.86 
 
 		 1002 aa  485  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1103 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 1011 aa  482  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1150 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1168 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 1025 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1051 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.36 
 
 		 1063 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1059 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1179 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1076 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 1041 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1049 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1202 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1040 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1036 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 1128 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 1064 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>