More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1778 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  37.44 
 
 		 1066 aa  650    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  42.19 
 
 		 1079 aa  739    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  39.32 
 
 		 1181 aa  702    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  41.59 
 
 		 1155 aa  764    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  37.73 
 
 		 1177 aa  666    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  36.52 
 
 		 1071 aa  653    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1039 aa  2128    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  41.39 
 
 		 1050 aa  792    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  37.79 
 
 		 1161 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  37.17 
 
 		 1173 aa  620  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  36.16 
 
 		 1037 aa  601  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  37.37 
 
 		 1148 aa  589  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 1038 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 1029 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 1026 aa  572  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 1071 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  36.05 
 
 		 1124 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  35.67 
 
 		 1117 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 982 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1023 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  35.88 
 
 		 1155 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  35.72 
 
 		 1122 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 1114 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  35.94 
 
 		 989 aa  553  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 1000 aa  552  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  35.69 
 
 		 1051 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 1023 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 986 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  37.28 
 
 		 1164 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 1038 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1076 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 1012 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 1132 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 		 1008 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1076 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.73 
 
 		 1028 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.37 
 
 		 1023 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1027 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  33.99 
 
 		 1152 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1137 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1071 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1076 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1006 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1060 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 		 1052 aa  515  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1081 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 1085 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  34.7 
 
 		 1163 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1079 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1010 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  33.14 
 
 		 1018 aa  511  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1051 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 1097 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  33.98 
 
 		 1047 aa  509  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1066 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  34.59 
 
 		 1128 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 1020 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1034 aa  502  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1058 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1116 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  34.19 
 
 		 1010 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 1031 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1017 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 1049 aa  498  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  33.76 
 
 		 1119 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  33.99 
 
 		 1154 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 1019 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 1177 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1147 aa  496  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.88 
 
 		 1063 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1034 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 1059 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 1140 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 996 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  32.19 
 
 		 1041 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 994 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 1014 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 1043 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1064 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 979 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1082 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1053 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1127 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1172 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 999 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1103 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1003 aa  479  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 993 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1036 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1023 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1168 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1021 aa  476  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1060 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1039 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1040 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1006 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1150 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1026 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1179 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 1025 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>