More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2137 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  39.08 
 
 		 1161 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  41.33 
 
 		 1181 aa  745    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  40.33 
 
 		 1173 aa  735    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  40.17 
 
 		 1066 aa  774    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  41.57 
 
 		 1155 aa  777    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  42.22 
 
 		 1177 aa  791    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  37.16 
 
 		 1071 aa  658    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  37.54 
 
 		 1122 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  39.78 
 
 		 1071 aa  762    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  36.55 
 
 		 1038 aa  656    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  42.31 
 
 		 1039 aa  786    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1050 aa  2147    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  62.28 
 
 		 1079 aa  1331    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 1023 aa  631  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  36.67 
 
 		 1066 aa  629  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 1037 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  35.55 
 
 		 1148 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  36.23 
 
 		 1114 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.47 
 
 		 1023 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  35.16 
 
 		 1079 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 		 1058 aa  595  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 1081 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.12 
 
 		 1026 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  35.83 
 
 		 982 aa  582  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  36.63 
 
 		 1060 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 1124 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 1029 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 		 1117 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 1038 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 1000 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.64 
 
 		 1041 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  36.19 
 
 		 1096 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 1128 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  35.47 
 
 		 1097 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 		 1137 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  33.99 
 
 		 1119 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1027 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 		 1010 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  36.58 
 
 		 1023 aa  548  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 986 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.61 
 
 		 1132 aa  544  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1006 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.57 
 
 		 1008 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1039 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1155 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  34.96 
 
 		 1071 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 1172 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1051 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  34.47 
 
 		 1047 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 1021 aa  532  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 994 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.75 
 
 		 1164 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 1006 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 1051 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1036 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 1085 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 989 aa  523  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1096 aa  524  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1154 aa  526  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1028 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 		 1163 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  35.02 
 
 		 1076 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 1147 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 		 1076 aa  523  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1152 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1042 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 1019 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1053 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 1103 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1082 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 		 996 aa  515  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  34.96 
 
 		 1106 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  34.61 
 
 		 1017 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  34.22 
 
 		 1192 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1116 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 1033 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1034 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  34.27 
 
 		 1010 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1049 aa  505  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 1020 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 1034 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 1043 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1012 aa  503  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  34.85 
 
 		 1076 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 1177 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1075 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  35.04 
 
 		 1087 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1052 aa  502  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1150 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  32.4 
 
 		 1018 aa  497  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.93 
 
 		 1063 aa  499  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 999 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  33.36 
 
 		 1011 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 1014 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1040 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.92 
 
 		 1060 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1077 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 1025 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 996 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1064 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>