More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2523 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  43.64 
 
 		 1039 aa  801    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  43.55 
 
 		 1041 aa  792    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  38.31 
 
 		 1177 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  39.98 
 
 		 1038 aa  661    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  43.56 
 
 		 1161 aa  777    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  44.61 
 
 		 1037 aa  782    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  40.96 
 
 		 1029 aa  669    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1019 aa  2050    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  38.25 
 
 		 1006 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  38.54 
 
 		 1114 aa  621  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  38.27 
 
 		 1124 aa  612  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  38.16 
 
 		 1117 aa  611  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  38.17 
 
 		 1008 aa  611  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  38.08 
 
 		 1066 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  36.83 
 
 		 1000 aa  600  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  36.28 
 
 		 1181 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  36.41 
 
 		 1155 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 1097 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1132 aa  587  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  36.68 
 
 		 1051 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  36.77 
 
 		 1023 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  37.44 
 
 		 1163 aa  572  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  36.25 
 
 		 1128 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 1071 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 989 aa  563  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1155 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 982 aa  552  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1173 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1028 aa  539  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  36.32 
 
 		 1116 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 		 1079 aa  538  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1071 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 986 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1147 aa  535  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  37.45 
 
 		 1012 aa  532  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  34.82 
 
 		 1063 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 1025 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 1026 aa  529  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1010 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1059 aa  522  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  35.17 
 
 		 1154 aa  519  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 1050 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  37.24 
 
 		 1013 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1027 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 		 1051 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  35.1 
 
 		 999 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1017 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 1053 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1150 aa  509  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 994 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1076 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 		 1023 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 1034 aa  502  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 		 1075 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1076 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1152 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 		 1039 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 1140 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 		 1050 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 1043 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 1040 aa  496  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 996 aa  496  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1006 aa  492  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1154 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1081 aa  493  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 1014 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1076 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1148 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1023 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 1038 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 1014 aa  477  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 979 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1060 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  32.99 
 
 		 1024 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  33.94 
 
 		 1019 aa  476  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 1028 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1096 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 1198 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 1154 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1034 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 1041 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 		 1103 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 1020 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 993 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1049 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 		 1164 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1066 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1096 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 996 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1052 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1079 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1064 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1071 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1077 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1122 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1006 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1129 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1023 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1106 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 1033 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>