More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2109 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1154 aa  2337    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  36.47 
 
 		 1129 aa  687    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1177 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 1037 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1010 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1116 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1117 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1161 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1132 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1154 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1114 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1066 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1124 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 999 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 982 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 986 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 1029 aa  486  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 1140 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1038 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.27 
 
 		 1041 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 1019 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1027 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1039 aa  476  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1148 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1155 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1155 aa  476  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1173 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1163 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1154 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1008 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 1071 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1128 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 1014 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1043 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1051 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.9 
 
 		 1023 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 1025 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 1000 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1051 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 994 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1150 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1028 aa  443  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1152 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1122 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1006 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1079 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1181 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1076 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  31.55 
 
 		 1019 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 996 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1071 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1023 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  30.92 
 
 		 1024 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1077 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1023 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1012 aa  425  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1076 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1076 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 989 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1053 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1097 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1177 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1161 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1127 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1113 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1082 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1059 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1198 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1058 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1172 aa  413  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1066 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.7 
 
 		 1063 aa  409  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1147 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1096 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1041 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1102 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1106 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1164 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 1026 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1120 aa  400  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 1028 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 1050 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1060 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1192 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1023 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1040 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1096 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 1144 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1052 aa  393  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1119 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1017 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 997 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1160 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1006 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1079 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1116 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1034 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1049 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1103 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1119 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>