More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0343 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  47 
 
 
1163 aa  854    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  47.96 
 
 
1051 aa  934    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  46.97 
 
 
1132 aa  909    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  51.8 
 
 
1152 aa  1026    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  45.69 
 
 
1059 aa  880    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  49.71 
 
 
1028 aa  967    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
1096 aa  2230    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  48.12 
 
 
1150 aa  931    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  43.36 
 
 
1154 aa  786    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  37.88 
 
 
1053 aa  632  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  38.58 
 
 
1040 aa  626  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  36.82 
 
 
1161 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  37.43 
 
 
1038 aa  591  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  37.06 
 
 
1049 aa  588  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 
1037 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 
1080 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 
1114 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 
1155 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 
1181 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  34.52 
 
 
1080 aa  549  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 
1117 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 
1063 aa  544  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.85 
 
 
1051 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  35.41 
 
 
1124 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 
1029 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 
1177 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 
1066 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 
1006 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 
1021 aa  535  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 
1000 aa  529  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 
1050 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.68 
 
 
1041 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
1155 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.58 
 
 
989 aa  510  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.6 
 
 
1148 aa  506  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 
1071 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.7 
 
 
1012 aa  498  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 
1079 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.16 
 
 
1008 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 
1116 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 
986 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 
1039 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 
1038 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 
1071 aa  483  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 
1010 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 
1097 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 
994 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 
1081 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 
999 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 
982 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 
1173 aa  473  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
1129 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 
1164 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 
1023 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.44 
 
 
1023 aa  466  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 
1014 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 
996 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 
1019 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 
1154 aa  463  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 
1023 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 
1128 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 
1076 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 
1026 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 
1043 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 
1025 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 
1041 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 
1122 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 
1066 aa  452  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 
1027 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 
979 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 
1096 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 
1060 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 
1140 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 
1036 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 
1052 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 
1113 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 
1119 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 
1064 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 
1172 aa  433  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.94 
 
 
1063 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 
1137 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 
1071 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 
1006 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 
1013 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  32.86 
 
 
1002 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 
1075 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 
1062 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  31.25 
 
 
1024 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.97 
 
 
1019 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 
1011 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 
1014 aa  422  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 
1006 aa  420  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  31.46 
 
 
1047 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 
1043 aa  420  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 
1082 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  30.84 
 
 
1018 aa  419  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 
1023 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 
1023 aa  412  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 
1065 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 
1010 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>