More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0687 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  39.72 
 
 		 1177 aa  707    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  38.45 
 
 		 1122 aa  718    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  36.62 
 
 		 1071 aa  636    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  37.13 
 
 		 1066 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1066 aa  2152    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  37.96 
 
 		 1023 aa  680    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  36.41 
 
 		 1079 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 1050 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  37.88 
 
 		 1181 aa  622  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  36.67 
 
 		 1081 aa  613  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  36.78 
 
 		 1036 aa  608  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  37.14 
 
 		 1173 aa  602  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  37.65 
 
 		 1079 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.55 
 
 		 1155 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1060 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1058 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.21 
 
 		 1161 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 1071 aa  546  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 1037 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1148 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 989 aa  525  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 1051 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1038 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 1029 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1147 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 986 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1116 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1132 aa  499  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1039 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1114 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 982 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1028 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1006 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1172 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 1117 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1010 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1039 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  31.97 
 
 		 1047 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1124 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1119 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1128 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1023 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1012 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 1000 aa  472  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.27 
 
 		 1041 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1129 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1008 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 996 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1152 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1021 aa  466  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 999 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  33.16 
 
 		 1137 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 1019 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1163 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1071 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 1140 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 1038 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 1026 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1027 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.69 
 
 		 1063 aa  456  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1051 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1059 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 994 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1096 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1097 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 1023 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 979 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.95 
 
 		 1023 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 1177 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1164 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 1080 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1150 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1076 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1096 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1006 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  32.5 
 
 		 925 aa  439  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1064 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1076 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1060 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 1025 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1076 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 1034 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1102 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 1033 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1103 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1082 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.29 
 
 		 1002 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1085 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1154 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1113 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 1014 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 1043 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1155 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1161 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  30.84 
 
 		 1024 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  31.68 
 
 		 1005 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1075 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1010 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 997 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  30.24 
 
 		 1018 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>