More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1012 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 994 aa  2008    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  77.14 
 
 		 996 aa  1587    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  39.15 
 
 		 1161 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  38.82 
 
 		 1037 aa  618  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  38.08 
 
 		 1124 aa  602  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  36.49 
 
 		 1114 aa  591  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  38.1 
 
 		 1097 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  35.18 
 
 		 1117 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 		 1038 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  36.1 
 
 		 1000 aa  558  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  35.86 
 
 		 1128 aa  559  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.79 
 
 		 1038 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 1029 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 982 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  35.13 
 
 		 1177 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.72 
 
 		 1008 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  35.18 
 
 		 1122 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  35.43 
 
 		 1116 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.44 
 
 		 1155 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  36.52 
 
 		 1129 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 1066 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 1050 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 1071 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  34.98 
 
 		 1063 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1132 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1051 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.33 
 
 		 989 aa  516  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 		 1010 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  34.33 
 
 		 1163 aa  509  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1006 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 		 1076 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1155 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1181 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  36.52 
 
 		 1164 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1079 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 1019 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 986 aa  506  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  35.47 
 
 		 1026 aa  506  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1076 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1028 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1076 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  34.7 
 
 		 1027 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 1026 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1023 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1071 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1075 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1039 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 1051 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 1025 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1017 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1079 aa  483  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1096 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.98 
 
 		 1041 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1013 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1198 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1064 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1096 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1059 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 1148 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 1014 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 1039 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 1043 aa  476  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 1177 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1034 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1081 aa  473  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 		 1012 aa  473  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1082 aa  473  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1103 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1154 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1023 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1023 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1052 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1173 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 979 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1154 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1060 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1071 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1152 aa  466  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1085 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 996 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1137 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 999 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1041 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 1144 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 1128 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  35.1 
 
 		 1006 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1077 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1053 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1066 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1150 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 1020 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1058 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1047 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1060 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 1080 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1014 aa  452  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 1003 aa  452  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  33.04 
 
 		 1002 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 1154 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1010 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>