More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0725 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 1154 aa  684    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1129 aa  2282    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  38.93 
 
 		 1038 aa  596  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1124 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  33.25 
 
 		 1177 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 1114 aa  576  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 1116 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1132 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1150 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 		 1037 aa  566  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  36.41 
 
 		 1161 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1117 aa  554  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1181 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1163 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.7 
 
 		 1026 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 		 982 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.47 
 
 		 1127 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1152 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 1000 aa  528  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1154 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 1025 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 1012 aa  528  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 1140 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 994 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1155 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 1029 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1008 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1154 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1097 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 1076 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1051 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1128 aa  506  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1010 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 1071 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1122 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1028 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1155 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.7 
 
 		 989 aa  490  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.11 
 
 		 1023 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1146 aa  492  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1006 aa  493  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 1038 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1076 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1023 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 996 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 		 999 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 986 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1071 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.81 
 
 		 1164 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.54 
 
 		 1063 aa  482  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1148 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1192 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 1144 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1076 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1027 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1066 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1113 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1079 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1143 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1102 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1023 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1103 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 1041 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 1014 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1096 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1066 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1173 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1147 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1077 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 1043 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1059 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 1028 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1189 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.27 
 
 		 1041 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1079 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1202 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1096 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 1019 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1017 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1131 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1006 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1010 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1071 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1052 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 1080 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1051 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1161 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1081 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1139 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1120 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1119 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1013 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1082 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 1034 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 1175 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1198 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  32.54 
 
 		 1024 aa  446  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1023 aa  445  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1026 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 1050 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>