More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3588 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 986 aa  2017    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  44.58 
 
 		 989 aa  853    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  63.32 
 
 		 982 aa  1296    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  39.08 
 
 		 1161 aa  663    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  36.8 
 
 		 1038 aa  635  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  38.52 
 
 		 1177 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  38.04 
 
 		 1037 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  36.62 
 
 		 1114 aa  610  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 1043 aa  607  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  36.68 
 
 		 1181 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  37.12 
 
 		 1124 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  37.17 
 
 		 1012 aa  591  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  36.15 
 
 		 1039 aa  591  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1066 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 999 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 1029 aa  585  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  36.28 
 
 		 1008 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  37.37 
 
 		 1097 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  35.22 
 
 		 1006 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 1155 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 1014 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  34.92 
 
 		 1027 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.67 
 
 		 1117 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 1071 aa  566  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 		 1010 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  35.15 
 
 		 1023 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  37.17 
 
 		 1026 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1079 aa  555  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1164 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 1028 aa  549  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1023 aa  545  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 1050 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.86 
 
 		 1052 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  35.91 
 
 		 1128 aa  542  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 996 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 1019 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 1020 aa  539  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.72 
 
 		 1041 aa  536  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  34.19 
 
 		 1063 aa  534  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.19 
 
 		 1051 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  34.68 
 
 		 1006 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 1173 aa  535  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  34.16 
 
 		 1132 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1039 aa  529  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 1071 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 1023 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1152 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1076 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1064 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 1000 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1036 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1163 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 1053 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 1140 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1154 aa  512  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 		 1116 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1119 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1155 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  34.24 
 
 		 1080 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  33.56 
 
 		 1043 aa  509  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 1028 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1120 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 1034 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 994 aa  506  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1075 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1103 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 1177 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1148 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1066 aa  501  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1051 aa  502  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 1122 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 1038 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1062 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  33.94 
 
 		 1019 aa  495  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1137 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1059 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  34.19 
 
 		 1005 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 1128 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1150 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1031 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 1096 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 1063 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  33.11 
 
 		 1024 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1079 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 1041 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1147 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1129 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 1071 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1021 aa  482  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 1049 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 1025 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1040 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 1154 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 1010 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1076 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  33.07 
 
 		 1002 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 1033 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 1116 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1003 aa  473  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1023 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>