More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2283 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  45.07 
 
 		 1154 aa  947    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  38.94 
 
 		 1029 aa  650    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1132 aa  2293    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  39 
 
 		 1053 aa  689    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  51.28 
 
 		 1163 aa  1114    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  46.77 
 
 		 1150 aa  1011    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  38.18 
 
 		 1038 aa  656    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  47.3 
 
 		 1152 aa  1011    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  54.48 
 
 		 1028 aa  1112    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  37.26 
 
 		 1080 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  46.97 
 
 		 1096 aa  909    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  36.23 
 
 		 1177 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  36.46 
 
 		 1116 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  53 
 
 		 1051 aa  1074    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  48.53 
 
 		 1059 aa  971    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1114 aa  636    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 1037 aa  669    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  39.87 
 
 		 1040 aa  714    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  39.09 
 
 		 1049 aa  676    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  40.13 
 
 		 1161 aa  709    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1155 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 1124 aa  623  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  36.4 
 
 		 1039 aa  592  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  36.42 
 
 		 1041 aa  595  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  35.05 
 
 		 1173 aa  595  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  36.33 
 
 		 1080 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 1019 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 1071 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  38.39 
 
 		 1012 aa  581  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  35.25 
 
 		 1006 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 1148 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  35.49 
 
 		 1181 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1117 aa  571  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1129 aa  566  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1097 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  35.4 
 
 		 1079 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 982 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.13 
 
 		 1122 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1128 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.19 
 
 		 1066 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.17 
 
 		 1008 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 		 1063 aa  555  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1127 aa  556  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 1071 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1051 aa  552  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1076 aa  549  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 1050 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1155 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 1000 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 1140 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1154 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1076 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  35.33 
 
 		 1023 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.1 
 
 		 1026 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.16 
 
 		 986 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 999 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 989 aa  525  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1076 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 1025 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1027 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 1014 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 994 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1021 aa  518  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1147 aa  519  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1081 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 996 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1060 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1192 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1010 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 1039 aa  513  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1146 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1096 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1066 aa  499  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1023 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1006 aa  499  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1042 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 1154 aa  496  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  33.03 
 
 		 1063 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1077 aa  496  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.67 
 
 		 1164 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 1038 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 996 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1013 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 1043 aa  493  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1023 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.92 
 
 		 1075 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1113 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1168 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1082 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1131 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 1189 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1036 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1087 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1062 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1079 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 1034 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1014 aa  476  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 1033 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1036 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1103 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>