More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4206 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  38.81 
 
 		 1010 aa  643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1023 aa  2061    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  54.8 
 
 		 1027 aa  1095    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  37.98 
 
 		 1161 aa  629  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  38.31 
 
 		 1043 aa  618  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  36.86 
 
 		 1037 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1066 aa  601  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  36.58 
 
 		 999 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 1050 aa  596  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  36.9 
 
 		 982 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  36.03 
 
 		 1177 aa  591  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  37.07 
 
 		 1008 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 1038 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  36.75 
 
 		 1006 aa  557  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.25 
 
 		 1155 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 1014 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  34.54 
 
 		 1120 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 1028 aa  550  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1114 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 		 1071 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 1029 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 986 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  34.92 
 
 		 997 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 1026 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 1071 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1079 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 1039 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 		 1117 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1097 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  35.88 
 
 		 1024 aa  528  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1006 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  35.04 
 
 		 1181 aa  526  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.28 
 
 		 989 aa  525  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 1140 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 1124 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1122 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 1076 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  35.34 
 
 		 1019 aa  514  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 1128 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1155 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 1000 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  34.8 
 
 		 1148 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  34.66 
 
 		 925 aa  508  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1023 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 1019 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1173 aa  502  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 1039 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1051 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1132 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 976 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  32.78 
 
 		 1041 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1006 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 1025 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 994 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1006 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 996 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 1116 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 996 aa  496  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.7 
 
 		 1164 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 1038 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1129 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1051 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1028 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1034 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1177 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1154 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1103 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1081 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 979 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1017 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1075 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1059 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1147 aa  477  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  32.25 
 
 		 1035 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 		 1071 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1066 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1064 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.31 
 
 		 1063 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1076 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1076 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1096 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1013 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1053 aa  466  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1152 aa  466  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1021 aa  463  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1087 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1096 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 1012 aa  462  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1163 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1040 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1042 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1082 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1062 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1060 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1036 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 1192 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1023 aa  452  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1079 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1085 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.3 
 
 		 1023 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>