More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4222 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  38.05 
 
 		 1161 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  37.03 
 
 		 1027 aa  663    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1010 aa  2034    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  38.57 
 
 		 1023 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  38.35 
 
 		 999 aa  629  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  36.28 
 
 		 1037 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  37.98 
 
 		 1014 aa  618  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  37.9 
 
 		 1043 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  35.69 
 
 		 1038 aa  599  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 982 aa  601  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  36.35 
 
 		 1114 aa  595  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 1177 aa  592  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  36.92 
 
 		 1120 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  36.82 
 
 		 1066 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  36.09 
 
 		 1117 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  37.22 
 
 		 989 aa  576  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  35.5 
 
 		 1024 aa  572  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  36.66 
 
 		 1051 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  35.15 
 
 		 986 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 		 1039 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  36.66 
 
 		 1008 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 1028 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1006 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.16 
 
 		 1071 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1155 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 1029 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  35.41 
 
 		 1019 aa  551  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.33 
 
 		 1079 aa  548  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 1050 aa  549  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1181 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  36.55 
 
 		 996 aa  542  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  34.57 
 
 		 1023 aa  542  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 		 1051 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.67 
 
 		 1041 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1006 aa  532  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 1173 aa  532  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 1154 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  34.79 
 
 		 1063 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 1019 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 1000 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  35.47 
 
 		 1023 aa  524  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  35.06 
 
 		 1028 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 1122 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1147 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  35.01 
 
 		 1154 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1163 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 1012 aa  514  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 1071 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 994 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  34.19 
 
 		 1076 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1132 aa  512  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 1140 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1152 aa  509  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 1124 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 1116 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  34.91 
 
 		 925 aa  504  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1129 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 		 1026 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 997 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1148 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1076 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1053 aa  496  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1039 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1064 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1076 aa  492  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1049 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1006 aa  489  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1023 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1128 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1059 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 1075 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1096 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1062 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1066 aa  481  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1150 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 1014 aa  480  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 1080 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 1017 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  32.47 
 
 		 1035 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1085 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 1097 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 1038 aa  476  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1155 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1034 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1081 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1042 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 1177 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 1063 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1096 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 1020 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1036 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1103 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1154 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 992 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 996 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1060 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 1065 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 1034 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 979 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1040 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>