More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1343 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1014 aa  2095    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 		 1037 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 		 1161 aa  529  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 1000 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1028 aa  524  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.76 
 
 		 1012 aa  516  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1006 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1038 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1114 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1117 aa  493  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 1010 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1051 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1177 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 1019 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1132 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 982 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1008 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1163 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 989 aa  470  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.78 
 
 		 1041 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1155 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 1066 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 1029 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1039 aa  466  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1181 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1147 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 994 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1116 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1059 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 996 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.95 
 
 		 1023 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1051 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1076 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 1050 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1128 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 986 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1040 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 1025 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 1014 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1021 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 979 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1198 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 999 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1150 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1053 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1076 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 1034 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1071 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 1071 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1075 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.68 
 
 		 1063 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1006 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1023 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1173 aa  432  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1076 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1155 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1027 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 1043 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1103 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 1038 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1097 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  29.86 
 
 		 1024 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  31.16 
 
 		 1019 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1128 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1096 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1152 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1017 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 1065 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1023 aa  422  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1004 aa  419  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  31.83 
 
 		 1005 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1154 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 996 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1049 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1034 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1064 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1079 aa  406  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  30.66 
 
 		 1005 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1039 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1023 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1023 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1125 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1060 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1154 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1102 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 1028 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 1041 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1106 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  29.48 
 
 		 1018 aa  402  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1081 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1010 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 1063 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1172 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 1033 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 1026 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 1083 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1113 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 1011 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 		 1002 aa  393  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1120 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>