More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2431 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1011 aa  2025    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  53.21 
 
 
1004 aa  1060    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  37.5 
 
 
1043 aa  579  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 
1116 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  36.02 
 
 
1036 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 
1026 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 
1049 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  36.58 
 
 
1012 aa  528  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 
1029 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.6 
 
 
1161 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 
1177 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  33.8 
 
 
1063 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 
1181 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 
1177 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 
1038 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 
1037 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 
1066 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  34.77 
 
 
1034 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 
1155 aa  503  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 
1023 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 
1006 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  34.19 
 
 
1023 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 
1050 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 
1128 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  35.03 
 
 
1002 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 
1060 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 
989 aa  486  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 
1020 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 
1122 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 
1033 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 
1008 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 
1079 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 
1164 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 
1020 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 
982 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 
1075 aa  473  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 
986 aa  473  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 
1124 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 
1173 aa  473  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  34.32 
 
 
1010 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 
1010 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 
1128 aa  465  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 
1071 aa  466  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 
1079 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 
1000 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 
1031 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 
996 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 
1081 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 
1039 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 
1114 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 
1154 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 
1064 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 
1028 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  31.59 
 
 
1080 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  32.65 
 
 
1041 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 
1006 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 
1053 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 
1013 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  33.66 
 
 
1005 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 
1117 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 
1163 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 
1060 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 
1116 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 
1039 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 
1168 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 
1132 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 
1019 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 
1003 aa  439  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 
1097 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 
1036 aa  435  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 
1071 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 
1148 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 
1049 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 
1077 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 
1062 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 
1058 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 
1052 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 
1096 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 
1019 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 
1082 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 
1139 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 
1051 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 
1085 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 
994 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 
1119 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 
1021 aa  422  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 
1083 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 
1140 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 
975 aa  418  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 
1059 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 
1084 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 
1147 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 
1137 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 
1175 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 
1036 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 
1161 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 
1038 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 
1031 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 
1033 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 
1065 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>