More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1128 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  53.4 
 
 		 1011 aa  1052    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1004 aa  2040    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  34.71 
 
 		 1043 aa  512  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1012 aa  509  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1181 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 		 1116 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 1010 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1060 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1038 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.93 
 
 		 1026 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 1177 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 1037 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 982 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.14 
 
 		 1023 aa  486  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1066 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.07 
 
 		 1161 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1036 aa  483  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1155 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 1049 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1177 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  34.22 
 
 		 1020 aa  476  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1028 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 1034 aa  472  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1003 aa  469  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1020 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 986 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.71 
 
 		 1063 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1124 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 989 aa  459  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 1029 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1164 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1006 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  33.56 
 
 		 1005 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1013 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1023 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 1008 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 1033 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1132 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 1000 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.14 
 
 		 1041 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 		 1071 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  33.13 
 
 		 1116 aa  443  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1114 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1085 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1128 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1031 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 996 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.19 
 
 		 1002 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 1010 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 1189 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1052 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 1128 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1075 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1049 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1084 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1163 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1006 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 1050 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1051 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1064 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  30.43 
 
 		 1080 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1148 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1071 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1129 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 1033 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1127 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1152 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1040 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1097 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 1130 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1081 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 975 aa  411  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1122 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1119 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1053 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 1063 aa  413  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1036 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 996 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1014 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 1175 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1096 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1039 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1147 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1173 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1117 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 1139 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1103 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1059 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 1047 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 999 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 994 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1082 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1161 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1017 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1066 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 1041 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 1083 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1034 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 1140 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1036 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>