More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6740 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  56.13 
 
 		 1049 aa  1124    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1116 aa  2272    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  41.36 
 
 		 1036 aa  726    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 1026 aa  621  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  39.09 
 
 		 1043 aa  612  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  35.69 
 
 		 1177 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 1177 aa  592  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 1033 aa  586  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  37.42 
 
 		 1037 aa  582  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  37.18 
 
 		 1011 aa  579  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  37.61 
 
 		 1164 aa  578  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 1012 aa  570  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 1128 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1202 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 1139 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 1020 aa  557  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  36.3 
 
 		 1066 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  35.33 
 
 		 1063 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 1161 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 1175 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 1155 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1130 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  35.44 
 
 		 1023 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1124 aa  542  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  33.5 
 
 		 1192 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 1189 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.74 
 
 		 1008 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  35.02 
 
 		 1004 aa  528  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  35.43 
 
 		 1006 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 989 aa  526  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  34.67 
 
 		 1084 aa  522  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1060 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1127 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 1029 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  35.25 
 
 		 1075 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1064 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1097 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1010 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1116 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  35.39 
 
 		 1031 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1148 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1038 aa  506  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 986 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 1163 aa  502  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1082 aa  503  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1020 aa  499  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  34.3 
 
 		 1005 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 1181 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1096 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1146 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1128 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1132 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1079 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1114 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1161 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1179 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  35.09 
 
 		 1002 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1131 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1150 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1052 aa  489  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1077 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 1034 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1138 aa  486  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1062 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1168 aa  483  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  34.49 
 
 		 1083 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 1140 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 1050 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1023 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1085 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1006 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.86 
 
 		 1041 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  34.63 
 
 		 1060 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1122 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1077 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 1010 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1154 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1003 aa  471  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 1093 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1164 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1013 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1154 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 982 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 1130 aa  466  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1071 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1039 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1026 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1071 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1023 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1129 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1123 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1036 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1150 aa  453  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 1040 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1028 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1031 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 994 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 1065 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1051 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1155 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>