More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0277 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  39.15 
 
 		 1060 aa  729    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1096 aa  2200    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  37.47 
 
 		 1064 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  56.14 
 
 		 1077 aa  1195    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  42.65 
 
 		 1189 aa  805    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  35.96 
 
 		 1062 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  63.49 
 
 		 1083 aa  1370    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  41.03 
 
 		 1202 aa  782    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  40.39 
 
 		 1082 aa  729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  40.66 
 
 		 1175 aa  780    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1085 aa  651    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  41.22 
 
 		 1084 aa  776    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 1164 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 1049 aa  499  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1066 aa  492  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 1026 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 1177 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 1055 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 1047 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1192 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 		 1036 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1116 aa  476  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1181 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.86 
 
 		 1023 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1179 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  31.41 
 
 		 1043 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1017 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1038 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 994 aa  443  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 1071 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1020 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1155 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1177 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  29.67 
 
 		 1005 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 1050 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1052 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1027 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 1014 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1137 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 1038 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1150 aa  423  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1130 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1081 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1010 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 996 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1051 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1071 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1173 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 1034 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1079 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1023 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1051 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 1025 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  30.63 
 
 		 1041 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1034 aa  403  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1039 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1076 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 1130 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 999 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1058 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1019 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1076 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 1140 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1102 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 1043 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1076 aa  393  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1172 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 1011 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1127 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1023 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1132 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1103 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1021 aa  385  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1036 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1004 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1155 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1079 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1006 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 996 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1122 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1119 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1023 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1168 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1042 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1096 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1053 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  29.67 
 
 		 1080 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1028 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1039 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1013 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1019 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1131 aa  367  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 1144 aa  366  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1087 aa  366  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1013 aa  364  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  27.84 
 
 		 1035 aa  364  4e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1031 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1168 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1147 aa  362  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1146 aa  360  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>