More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2710 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  37.48 
 
 		 1131 aa  703    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1127 aa  2301    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  38.38 
 
 		 1142 aa  748    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  45.08 
 
 		 1020 aa  805    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  45.5 
 
 		 1026 aa  844    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1146 aa  624  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1138 aa  611  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  39 
 
 		 1026 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  35.97 
 
 		 1036 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1013 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.36 
 
 		 1155 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1139 aa  554  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1132 aa  556  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 1130 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.88 
 
 		 1161 aa  549  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1177 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1124 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 1020 aa  537  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.47 
 
 		 1129 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1181 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 1144 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1019 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.7 
 
 		 1164 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  33.47 
 
 		 1168 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 		 1031 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1079 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1085 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1116 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1114 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  35.16 
 
 		 1010 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1095 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1066 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 1037 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 1046 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  35.13 
 
 		 1095 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1109 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1097 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 1033 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1064 aa  496  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1038 aa  496  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 1189 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 1012 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 1140 aa  495  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 1128 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1034 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1154 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1116 aa  489  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 1079 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1217 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1152 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1192 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1122 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1139 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1188 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.37 
 
 		 1023 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1050 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1082 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1150 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1148 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 1086 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1123 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 1056 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1190 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1053 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1039 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1128 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1117 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 1006 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1008 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 1175 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1173 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1202 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 1033 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1081 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 1029 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1071 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 1025 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 1045 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1006 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1036 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1047 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 996 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 1049 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1154 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 1038 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1060 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 1177 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1024 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1051 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 1028 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 994 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 989 aa  449  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 986 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1023 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1096 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1176 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1079 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1161 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1106 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1013 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>