More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3877 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  39.16 
 
 		 1094 aa  717    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1036 aa  2117    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  36.63 
 
 		 1109 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  36.28 
 
 		 1027 aa  581  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 		 1006 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 1056 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  35.27 
 
 		 1123 aa  555  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  35.96 
 
 		 1029 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  35.04 
 
 		 1145 aa  532  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 1018 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1130 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 1045 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 1033 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 937 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1079 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1095 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1095 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1127 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 1061 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 953 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1046 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1068 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1043 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 1130 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 1033 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1062 aa  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 1086 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 913 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1026 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1146 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 1144 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 929 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 1056 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1086 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1148 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1176 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1128 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 1025 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 1081 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1013 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 1026 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1038 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1056 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1036 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1131 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1047 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1139 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1138 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1019 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1161 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1038 aa  363  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1155 aa  362  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1074 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1181 aa  341  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1163 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1066 aa  339  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 1011 aa  338  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 1065 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1177 aa  337  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 1177 aa  337  9e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 1037 aa  336  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 996 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1050 aa  333  8e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1052 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1024 aa  331  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1028 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1010 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1064 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1010 aa  326  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1079 aa  325  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1027 aa  325  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 994 aa  325  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1055 aa  324  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1006 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1006 aa  322  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1004 aa  322  3e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1148 aa  320  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1058 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1173 aa  318  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1148 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 1033 aa  318  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.02 
 
 		 1043 aa  318  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1079 aa  317  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 1029 aa  318  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1128 aa  317  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1124 aa  317  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1192 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1064 aa  316  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1025 aa  316  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1023 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 917 aa  317  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1154 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1008 aa  315  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1036 aa  314  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 1041 aa  313  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1071 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 982 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 986 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  27.22 
 
 		 1005 aa  310  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1053 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>