More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0566 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1043 aa  2125    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  36.07 
 
 		 1006 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  35.58 
 
 		 1130 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 1123 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1033 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 1081 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1062 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1036 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1148 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1056 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1145 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1056 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1176 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1068 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1086 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1109 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1094 aa  406  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 1033 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1029 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1027 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 1061 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1079 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 937 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 1086 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 1018 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 953 aa  365  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 1056 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1047 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1046 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1095 aa  340  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 1045 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1128 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1127 aa  334  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1095 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1026 aa  331  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1013 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 1144 aa  325  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1164 aa  324  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 913 aa  318  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1038 aa  318  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1060 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 1130 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1034 aa  310  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 1025 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 929 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1146 aa  307  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1019 aa  301  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1036 aa  300  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 1093 aa  300  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1139 aa  300  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1155 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1148 aa  288  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1038 aa  284  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1131 aa  283  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1036 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1053 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1161 aa  279  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 1011 aa  278  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1128 aa  278  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 1037 aa  278  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1065 aa  278  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 1049 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 1132 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1168 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1055 aa  275  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1004 aa  274  7e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1024 aa  272  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1031 aa  271  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1079 aa  270  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1116 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 1020 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1058 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1138 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1147 aa  265  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1028 aa  263  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1148 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 989 aa  261  5.0000000000000005e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1008 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1181 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1150 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 1034 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1012 aa  258  5e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1128 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1059 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  26.8 
 
 		 1023 aa  254  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 1074 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1038 aa  254  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 917 aa  253  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1075 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1177 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 1065 aa  251  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1154 aa  251  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1102 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1164 aa  250  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 1075 aa  250  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1071 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1116 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1147 aa  248  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1152 aa  247  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1117 aa  247  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>