More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2299 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  47.37 
 
 		 1148 aa  915    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  55.35 
 
 		 1068 aa  1117    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  56.14 
 
 		 1176 aa  1162    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  49.1 
 
 		 1081 aa  953    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  47.19 
 
 		 1086 aa  929    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1056 aa  2141    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  56.88 
 
 		 1062 aa  1172    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  36.2 
 
 		 1033 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 1130 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1006 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1123 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1027 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1109 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1043 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1145 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1056 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 1061 aa  433  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 1033 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 1045 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 1144 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 1056 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1029 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1036 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 1018 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 937 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1094 aa  386  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1127 aa  366  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 1086 aa  363  8e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1026 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1095 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1142 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 953 aa  354  5e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1047 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1046 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1155 aa  351  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1131 aa  351  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1079 aa  349  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1128 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1095 aa  343  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1020 aa  342  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1181 aa  341  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1036 aa  340  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1168 aa  336  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1013 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 1130 aa  330  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1188 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 913 aa  328  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1124 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 1020 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1164 aa  327  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1079 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1138 aa  325  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1031 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1060 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1148 aa  321  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1045 aa  320  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1024 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1104 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1053 aa  318  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1217 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 929 aa  317  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1100 aa  317  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1148 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1039 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1128 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 1025 aa  315  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1163 aa  313  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 1029 aa  311  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 1050 aa  311  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1066 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 1038 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 1093 aa  307  8.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1079 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1038 aa  304  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1192 aa  303  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1058 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1051 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1052 aa  302  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1117 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1139 aa  300  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1128 aa  300  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  27.68 
 
 		 1063 aa  300  9e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 1041 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1161 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1006 aa  299  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1028 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1075 aa  297  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 1074 aa  297  9e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1071 aa  295  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1097 aa  295  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 1000 aa  294  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1116 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1012 aa  291  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1096 aa  291  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1042 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1051 aa  290  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1076 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1081 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1010 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1179 aa  288  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>