More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2722 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  37.07 
 
 		 1146 aa  687    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  44.54 
 
 		 1024 aa  833    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1139 aa  2328    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  41.26 
 
 		 1147 aa  845    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1127 aa  576  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1131 aa  572  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1164 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 		 1130 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  35.68 
 
 		 1026 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1190 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1020 aa  513  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1188 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1217 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1124 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1019 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1132 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 1026 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1138 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1013 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1045 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1031 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1155 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1104 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1064 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1123 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1168 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 		 1036 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 1093 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1077 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 1037 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1109 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 1144 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 1012 aa  442  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1161 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1082 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 1045 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1075 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1129 aa  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1163 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  30.92 
 
 		 1095 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1100 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1128 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1128 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1192 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1150 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1097 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 1189 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1116 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 1140 aa  423  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1154 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1046 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1143 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1202 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1034 aa  415  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1095 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1177 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 1020 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1181 aa  413  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1047 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1116 aa  413  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1114 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 1040 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1038 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1077 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1128 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1079 aa  403  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1036 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 1177 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1095 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1036 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1139 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 989 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1052 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1148 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1085 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1010 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1006 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1102 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1122 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 1033 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1060 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1164 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1139 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1064 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 982 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1011 aa  383  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1134 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1053 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 996 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1060 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1075 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1062 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1028 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1081 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 1050 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1145 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1071 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 1033 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1006 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1079 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>