More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1342 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1047 aa  2150    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1074 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 1065 aa  576  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 		 1148 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  35.5 
 
 		 1128 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  35.3 
 
 		 1055 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 1033 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 1056 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 1086 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 1144 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1095 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1095 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1079 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1127 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 1045 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1128 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1046 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 1061 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 1026 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1161 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1020 aa  428  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1006 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1155 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 1130 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1026 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1109 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1013 aa  413  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1131 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1027 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1036 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1019 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1146 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1138 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1188 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1029 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1181 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1164 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1006 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1094 aa  393  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1139 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1038 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 1029 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1008 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1024 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1036 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1036 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 1037 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1031 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1123 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1066 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1176 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1082 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1130 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1168 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1104 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1142 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1039 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 1060 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 1177 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1053 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1079 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 1018 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 1050 aa  373  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1064 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1100 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1114 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1012 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1217 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1064 aa  365  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1148 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1177 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 989 aa  365  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1036 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 1020 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1124 aa  363  8e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1058 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1058 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1062 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1042 aa  362  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1034 aa  357  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1006 aa  356  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1056 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1102 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1128 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 953 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1116 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.47 
 
 		 1023 aa  353  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1052 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1076 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 1040 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.94 
 
 		 1043 aa  351  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 1038 aa  352  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1010 aa  350  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1097 aa  351  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1145 aa  350  7e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1010 aa  349  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1051 aa  350  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 1011 aa  347  7e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1045 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1179 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>