More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1139 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1064 aa  2179    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  36.59 
 
 		 1104 aa  608  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  35.94 
 
 		 1188 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  35.55 
 
 		 1217 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 1100 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  36.01 
 
 		 1077 aa  554  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  33.76 
 
 		 1190 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 1045 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1075 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  32.98 
 
 		 1095 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  34.36 
 
 		 1020 aa  485  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1120 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 		 1034 aa  464  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1024 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1146 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1139 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 1130 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1139 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 1026 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1031 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1127 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1012 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1142 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1026 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1134 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1013 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1033 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1168 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1079 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 989 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1138 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1038 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1019 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1097 aa  383  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1164 aa  380  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1131 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1082 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1004 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1003 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1047 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 1020 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1095 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1036 aa  366  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1046 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 1086 aa  364  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1036 aa  364  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1155 aa  363  9e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1010 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1023 aa  360  6e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1128 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1116 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1119 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1084 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 1037 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1181 aa  357  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1079 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1177 aa  355  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1051 aa  354  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1064 aa  353  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 1045 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1095 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1052 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1060 aa  351  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1147 aa  350  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1006 aa  350  9e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1161 aa  348  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1066 aa  347  8e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 1093 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 1056 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 1050 aa  343  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 1038 aa  343  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 1011 aa  343  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1124 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 986 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 1114 aa  339  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 1175 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1117 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1102 aa  334  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  28.21 
 
 		 1063 aa  334  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1039 aa  334  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 1128 aa  334  6e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1164 aa  334  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 1000 aa  333  7.000000000000001e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 994 aa  334  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1081 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1094 aa  333  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.95 
 
 		 1043 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 1144 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 1177 aa  331  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1042 aa  330  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  28.72 
 
 		 1035 aa  330  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 1010 aa  330  9e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1137 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1192 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1062 aa  327  6e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1070 aa  327  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  29.25 
 
 		 1005 aa  326  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1036 aa  327  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1076 aa  325  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1036 aa  324  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>