More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3643 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  52.23 
 
 		 1079 aa  1160    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  56.55 
 
 		 1095 aa  1213    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1086 aa  2220    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  40.21 
 
 		 1056 aa  742    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  55.12 
 
 		 1095 aa  1210    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  40.04 
 
 		 1033 aa  763    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  53.15 
 
 		 1046 aa  1128    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1047 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1006 aa  496  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 1045 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 1144 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1127 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 1061 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1074 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1013 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1027 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 1026 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1168 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1031 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1109 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1020 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1123 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1026 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1128 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1036 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1034 aa  431  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1094 aa  432  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1055 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1058 aa  423  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1012 aa  421  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1130 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1155 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1145 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1036 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1181 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1056 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 1065 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1146 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1128 aa  406  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 1130 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1148 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1131 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1161 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1177 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1082 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1142 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1217 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1188 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 1018 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1064 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1019 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1029 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1128 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 1011 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1036 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1164 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1068 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1116 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1086 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1006 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1066 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1176 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1062 aa  380  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1053 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1008 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 1020 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1038 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1033 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 1081 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 1050 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1085 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 1038 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1051 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1132 aa  363  9e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 953 aa  363  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1043 aa  362  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1148 aa  362  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1060 aa  361  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1010 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 996 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1039 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1042 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 1037 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1147 aa  358  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1139 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 937 aa  357  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1028 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1031 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1138 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1064 aa  355  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1004 aa  355  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.03 
 
 		 1023 aa  354  4e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1096 aa  354  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1079 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1056 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1164 aa  350  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 1041 aa  350  9e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  29.12 
 
 		 1002 aa  349  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1152 aa  350  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1076 aa  349  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>