More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1421 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  44.89 
 
 
1045 aa  830    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1144 aa  2338    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  65.69 
 
 
1061 aa  1435    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  36.85 
 
 
1056 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 
1127 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 
1033 aa  522  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 
1142 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
1130 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 
1189 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 
1026 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 
1217 aa  506  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 
1079 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 
1128 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 
1047 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 
1155 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 
1168 aa  496  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 
1130 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 
1114 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 
1031 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 
1086 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 
1046 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 
1164 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 
1117 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 
1095 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 
1019 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 
1026 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 
1202 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 
1179 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 
1095 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 
1010 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 
1188 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 
1109 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 
1131 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 
1029 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 
1123 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 
1181 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 
1177 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 
1094 aa  456  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 
1177 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 
1034 aa  450  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 
1102 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 
1161 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 
1013 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 
1148 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 
1036 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 
1161 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 
1128 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 
1144 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 
1006 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 
1146 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 
1192 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 
1068 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 
1036 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 
1006 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 
1086 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 
1036 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 
1128 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 
1139 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 
1020 aa  425  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 
1038 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 
1062 aa  423  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 
1027 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 
1038 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 
1164 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 
1139 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 
1122 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 
937 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 
1096 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 
1148 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 
1060 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 
1050 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 
1037 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 
1058 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 
1176 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 
1132 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 
1129 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 
1076 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 
1056 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 
1012 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 
1024 aa  403  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 
982 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 
1020 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 
1064 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 
1056 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 
1076 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 
1018 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 
1008 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 
1084 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 
1066 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 
996 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 
1062 aa  393  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 
1082 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 
1093 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 
1124 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 
1052 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 
1029 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 
1079 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 
1145 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 
1065 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 
1028 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>