More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4760 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  61.57 
 
 		 1077 aa  1358    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1100 aa  2246    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  38.12 
 
 		 1120 aa  755    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  50.14 
 
 		 1190 aa  1066    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  42.34 
 
 		 1188 aa  793    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  56.64 
 
 		 1104 aa  1264    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  41.92 
 
 		 1075 aa  785    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  39.04 
 
 		 1217 aa  751    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  36.74 
 
 		 1045 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 1064 aa  557  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  33.55 
 
 		 1095 aa  495  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  33.81 
 
 		 1024 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1026 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1020 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1139 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1019 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1076 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1164 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1168 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1142 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 1026 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1031 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1181 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1076 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1127 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1146 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 1130 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1161 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1124 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1036 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1131 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1177 aa  383  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 1020 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 1038 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1155 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1079 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1047 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1051 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1034 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1079 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1058 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1155 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1012 aa  361  5e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1138 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1006 aa  357  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1027 aa  357  8.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1117 aa  356  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1046 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 1037 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 1050 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1082 aa  351  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1038 aa  351  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1062 aa  350  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 982 aa  350  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1075 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 1086 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1064 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1006 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1076 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 1056 aa  345  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 1128 aa  343  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 1045 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1010 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 1000 aa  342  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1114 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1008 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1164 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1097 aa  341  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1192 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1122 aa  341  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1060 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1013 aa  340  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 1189 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 1033 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1006 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1039 aa  338  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1179 aa  337  7.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1081 aa  337  9e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 1034 aa  336  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1173 aa  337  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 994 aa  335  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 1071 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1066 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1042 aa  334  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1145 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1202 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1123 aa  332  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1062 aa  330  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 1029 aa  330  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1023 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1147 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1085 aa  328  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1079 aa  327  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1096 aa  327  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 986 aa  326  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 		 1047 aa  326  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 1099 aa  323  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1060 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1119 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1128 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>