More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4979 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  37.64 
 
 		 1190 aa  767    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1188 aa  2410    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  42.52 
 
 		 1100 aa  773    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  39.05 
 
 		 1075 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  40.95 
 
 		 1077 aa  747    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  40.13 
 
 		 1104 aa  721    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  72.58 
 
 		 1217 aa  1794    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  38.09 
 
 		 1045 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1120 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  35.94 
 
 		 1064 aa  575  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  34.19 
 
 		 1095 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1024 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1142 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1146 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1127 aa  483  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1139 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 1139 aa  476  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 1144 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1147 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1164 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 1130 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 1020 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1134 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1026 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1138 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1168 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1155 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1031 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 1128 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1131 aa  423  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1097 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1124 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 1026 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1144 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1012 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1114 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1095 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1079 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1117 aa  406  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1148 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1034 aa  402  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1046 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1177 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1202 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 1045 aa  403  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1013 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1128 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1066 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 1020 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1047 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1096 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1128 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1095 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 1033 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1161 aa  393  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1053 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1036 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1036 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1017 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1128 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1019 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 1086 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1130 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 1050 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1179 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1102 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1106 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1192 aa  383  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1027 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1037 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1060 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 1038 aa  380  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1163 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1130 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 1056 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 1175 aa  373  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 1000 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1036 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1168 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1122 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1139 aa  367  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1161 aa  367  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1051 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1132 aa  366  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1028 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1023 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1173 aa  360  6e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1034 aa  360  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.58 
 
 		 1023 aa  360  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1006 aa  360  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1116 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1155 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1013 aa  357  8.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1123 aa  356  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.18 
 
 		 1041 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 1029 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 982 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1152 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1058 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 986 aa  353  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>