More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6660 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  39.05 
 
 		 1188 aa  703    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  41.73 
 
 		 1100 aa  767    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  40.3 
 
 		 1104 aa  701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  39.87 
 
 		 1077 aa  715    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1075 aa  2199    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  39.35 
 
 		 1217 aa  709    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  40.24 
 
 		 1190 aa  710    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  37.51 
 
 		 1045 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1120 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1064 aa  512  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  32.38 
 
 		 1095 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1024 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1146 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1020 aa  424  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1134 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1139 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1147 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1164 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1031 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1013 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1168 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1139 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1130 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 1026 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1019 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1036 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1127 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1138 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 1033 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1012 aa  355  2e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 1038 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1036 aa  350  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1147 aa  346  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1047 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1076 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1144 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1076 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1034 aa  340  5.9999999999999996e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1128 aa  340  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  28.77 
 
 		 1063 aa  340  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 994 aa  333  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 1086 aa  331  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1056 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 1050 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1037 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1040 aa  327  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1039 aa  326  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 1128 aa  326  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1079 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1058 aa  326  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 996 aa  325  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1155 aa  324  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1128 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1173 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1131 aa  322  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1082 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 1045 aa  318  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1075 aa  318  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1177 aa  317  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 1093 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 986 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 1034 aa  315  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1006 aa  314  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1053 aa  314  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.21 
 
 		 1023 aa  314  6.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1062 aa  313  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1181 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1013 aa  312  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 1049 aa  311  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1124 aa  311  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1164 aa  310  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1006 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1079 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1051 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1071 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1066 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1060 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 1061 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1079 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 982 aa  308  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1122 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1155 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1052 aa  305  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 1011 aa  303  8.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  27.23 
 
 		 1041 aa  303  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1148 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1006 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1023 aa  303  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 996 aa  301  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1123 aa  300  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1042 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1036 aa  299  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1017 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1076 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 953 aa  298  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1114 aa  297  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1062 aa  296  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1034 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1027 aa  295  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1097 aa  295  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>