More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4814 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1095 aa  2221    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  36.12 
 
 		 1134 aa  568  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 1139 aa  557  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  34.22 
 
 		 1188 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1064 aa  507  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 1045 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1217 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1190 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1100 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1077 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1075 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1120 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1024 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1139 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1020 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1026 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1138 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1146 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1036 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1034 aa  359  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  28.27 
 
 		 1063 aa  342  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1036 aa  341  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 989 aa  336  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1012 aa  332  2e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1036 aa  330  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1003 aa  328  4.0000000000000003e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1053 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1082 aa  326  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1084 aa  325  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 1055 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 1063 aa  322  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 1033 aa  320  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1129 aa  319  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1023 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1116 aa  311  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1010 aa  310  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 986 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 1038 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1189 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1066 aa  305  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1085 aa  304  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1150 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1131 aa  301  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1175 aa  301  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1164 aa  301  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1147 aa  298  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 982 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 994 aa  297  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1202 aa  297  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1060 aa  297  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1177 aa  295  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1049 aa  293  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1077 aa  290  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 1080 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1104 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1139 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1122 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1128 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 1029 aa  285  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 1056 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1176 aa  285  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1046 aa  283  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1173 aa  283  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 1010 aa  281  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1096 aa  281  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1128 aa  280  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 1081 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1052 aa  279  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 996 aa  278  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1137 aa  278  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 1083 aa  277  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1070 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 1079 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1096 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1058 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1037 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1021 aa  275  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 1003 aa  274  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1013 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 1014 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1006 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1148 aa  269  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1137 aa  267  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1110 aa  265  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  27.43 
 
 		 1035 aa  264  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1060 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 999 aa  262  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1023 aa  262  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 1094 aa  261  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 1041 aa  261  7e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 971 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 1061 aa  259  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 1055 aa  258  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1152 aa  258  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 1130 aa  257  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 1043 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1058 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1130 aa  251  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  27.22 
 
 		 993 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 976 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>