More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2445 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  35.73 
 
 		 1102 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  36.12 
 
 		 1119 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  50.25 
 
 		 971 aa  965    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1094 aa  2233    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  52.5 
 
 		 1103 aa  1102    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  37.88 
 
 		 996 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  38.71 
 
 		 999 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  35.67 
 
 		 1125 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 1090 aa  557  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  37.24 
 
 		 1005 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  35.49 
 
 		 971 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1137 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 1003 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1047 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1023 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 1094 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1114 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 1004 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1155 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1122 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1128 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 988 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1023 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1039 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 1029 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1124 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1037 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 1037 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 977 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1132 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1161 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1012 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1097 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 984 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1163 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1012 aa  388  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1150 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 1011 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 982 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 994 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1152 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  29.81 
 
 		 1063 aa  383  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1177 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 1025 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1008 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 986 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 1128 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1129 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 976 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 1050 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1013 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1117 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1147 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1079 aa  373  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.54 
 
 		 1023 aa  373  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1053 aa  373  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1179 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1113 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 1019 aa  373  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1154 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1066 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1027 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1006 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 989 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1087 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1096 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1036 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 1038 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 979 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1077 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1116 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 996 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.79 
 
 		 1041 aa  364  4e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 993 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1102 aa  360  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1181 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1028 aa  356  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1173 aa  355  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1049 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1051 aa  354  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1014 aa  354  5e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 975 aa  354  5e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1127 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1119 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  29.98 
 
 		 925 aa  352  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1076 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  29.55 
 
 		 993 aa  351  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1064 aa  347  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  28.56 
 
 		 1018 aa  345  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1076 aa  346  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 1043 aa  343  7e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1023 aa  343  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1155 aa  344  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1075 aa  343  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1023 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1192 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1116 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 1144 aa  341  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1172 aa  341  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1062 aa  341  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>