More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1213 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1090 aa  2204    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 
1003 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 
1094 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  37.15 
 
 
1005 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  35.15 
 
 
1103 aa  552  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  36.03 
 
 
1047 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 
1023 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 
1119 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  35.74 
 
 
1137 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 
1094 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 
1125 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 
1128 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 
1102 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 
1124 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 
976 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 
999 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 
971 aa  489  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 
1114 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 
1117 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  34.67 
 
 
1063 aa  472  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 
1011 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 
1008 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 
1155 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 
1029 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 
1097 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 
1161 aa  463  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 
1128 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 
1122 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 
1000 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 
982 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 
1116 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 
1006 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 
1039 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 
1129 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 
1004 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 
1037 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 
971 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 
996 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 
1148 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 
1164 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 
1025 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.15 
 
 
1023 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 
984 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 
1012 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 
1066 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  33.3 
 
 
1002 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 
1012 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 
989 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 
1037 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 
1177 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  31.81 
 
 
993 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 
1132 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 
1173 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  32.04 
 
 
1041 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 
994 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 
975 aa  415  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 
986 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 
1038 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 
1127 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 
1006 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 
1023 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 
1006 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 
1060 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 
1008 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 
1150 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 
1023 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 
977 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 
1077 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 
1163 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 
1161 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 
988 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 
1023 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 
1010 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  31.85 
 
 
979 aa  395  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 
1021 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 
1096 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 
1013 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 
1140 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 
1181 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  30.43 
 
 
1018 aa  393  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 
1154 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 
1152 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 
1050 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  31.83 
 
 
1005 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 
1034 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 
1071 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 
996 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 
1028 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 
1019 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 
1014 aa  389  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 
1049 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 
1080 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 
1144 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  29.9 
 
 
1035 aa  383  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 
1168 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 
1172 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 
1051 aa  383  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 
1155 aa  383  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 
1189 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 
1102 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>